Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema6bO54951 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6bO54951 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms