Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EdaO54693 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EdaO54693 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EdaO54693 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EdaO54693 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EdaO54693 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EdaO54693 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EdaO54693 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EdaO54693 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EdaO54693 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EdaO54693 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EdaO54693 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EdaO54693 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms