Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr6O54689 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms