Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FxnO35943 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FxnO35943 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FxnO35943 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FxnO35943 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FxnO35943 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FxnO35943 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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FxnO35943 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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FxnO35943 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FxnO35943 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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FxnO35943 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms