Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm44O35857 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timm44O35857 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Timm44O35857 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Timm44O35857 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Timm44O35857 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Timm44O35857 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Timm44O35857 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms