Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited2O35740 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited2O35740 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited2O35740 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited2O35740 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms