Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfibp2O35711 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms