Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn6O35646 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn6O35646 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms