Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc1a6O35544 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc1a6O35544 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms