Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TnxbO35452 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TnxbO35452 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
TnxbO35452 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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TnxbO35452 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TnxbO35452 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TnxbO35452 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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