Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Prrt1O35449 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Prrt1O35449 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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