Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smad6O35182 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smad6O35182 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms