Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Snap23O09044 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap23O09044 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms