Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MttpO08601 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MttpO08601 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MttpO08601 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MttpO08601 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MttpO08601 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MttpO08601 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MttpO08601 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MttpO08601 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MttpO08601 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MttpO08601 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MttpO08601 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MttpO08601 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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