Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf6O08584 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf6O08584 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf6O08584 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf6O08584 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf6O08584 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf6O08584 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf6O08584 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf6O08584 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms