Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsmbO08540 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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MsmbO08540 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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