Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20939L7N243 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm20939L7N243 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20939L7N243 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms