Protein–RNA interactions for Protein: K9J7D1

Gm6351, Predicted gene 6351, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6351K9J7D1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm6351K9J7D1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm6351K9J7D1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms