Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms