Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2056J3QQ02 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms