Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccer2J3QPU5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms