Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gm2035J3QP87 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm2035J3QP87 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm2035J3QP87 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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