Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm19965J3QNY8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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Gm19965J3QNY8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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Gm19965J3QNY8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm19965J3QNY8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm19965J3QNY8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms