Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc180J3QNE4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ccdc180J3QNE4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc180J3QNE4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms