Protein–RNA interactions for Protein: J3QN84

Gm21812, Predicted gene, 21812, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21812J3QN84 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm21812J3QN84 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21812J3QN84 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms