Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21972J3QN38 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21972J3QN38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms