Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm3727J3QM54 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm3727J3QM54 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3727J3QM54 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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