Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm6594J3QM43 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm6594J3QM43 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm6594J3QM43 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm6594J3QM43 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm6594J3QM43 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6594J3QM43 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm6594J3QM43 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm6594J3QM43 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm6594J3QM43 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6594J3QM43 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm6594J3QM43 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6594J3QM43 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6594J3QM43 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm6594J3QM43 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6594J3QM43 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6594J3QM43 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6594J3QM43 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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