Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms