Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn34c3J3QJW5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn34c3J3QJW5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn34c3J3QJW5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn34c3J3QJW5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c3J3QJW5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn34c3J3QJW5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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