Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20830J3KML6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20830J3KML6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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