Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20828J3KMI7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20828J3KMI7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms