Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AK157302I3ITR1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AK157302I3ITR1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AK157302I3ITR1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms