Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf148G3X9R7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms