Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp846G3X996 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp846G3X996 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms