Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScaperF8VQ70 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScaperF8VQ70 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms