Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms