Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf165E9QAU8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf165E9QAU8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms