Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms