Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh3b2E9Q3E1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh3b2E9Q3E1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms