Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc4E9Q236 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Abcc4E9Q236 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcc4E9Q236 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms