Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp54bE9PXC0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms