Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4931408C20RikE9PWP9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931408C20RikE9PWP9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms