Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syde2E9PUP1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde2E9PUP1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms