Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clca3bE9PUL3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clca3bE9PUL3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms