Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem200bD3Z0P8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem200bD3Z0P8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms