Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf217D3YYI7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf217D3YYI7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms