Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samd1D3YXK1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms