Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxpe3B9EKK6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxpe3B9EKK6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms