Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r180B9EK86 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms